Третий том «Лекций по истории философии» Гегеля охватывает два ключевых периода: философию Средних веков и философию Нового времени. Гегель начинает с анализа перехода от античности к христианскому мировоззрению, подчеркивая, что философия обретает свою сферу внутри христианского мира. Он подробно рассматривает неоплатонизм как предтечу христианской идеи абсолютного духа. Центральной темой становится процесс примирения конечного человеческого сознания с бесконечным Божественным началом.
Гегель исследует, как христианская доктрина о воплощении Логоса и Троице трансформировала философское мышление, требуя от человека осознания своей духовности и свободы. Вторая часть тома посвящена схоластике, которую Гегель характеризует как попытку мыслить в рамках заданных церковных догм. Он анализирует арабскую философию как посредника в передаче античного наследия, а также деятельность отцов церкви и великих схоластов, таких как Ансельм Кентерберийский, Петр Ломбардский и Фома Аквинский.
Гегель критикует схоластику за формализм и оторванность от реальной жизни, но признает важность ее вклада в развитие логического аппарата. Третья часть тома переходит к философии Нового времени, начиная с эпохи Возрождения и обращения к античным источникам. Гегель описывает процесс освобождения разума от церковного авторитета, становление эмпиризма и рационализма. Он анализирует взгляды Бэкона, Декарта, Спинозы, Локка и Лейбница, показывая, как философия постепенно переходит от метафизики субстанции к исследованию субъективности и познавательных способностей человека. Гегель подчеркивает, что современная философия начинается с Декарта, который утверждает самосознание как фундамент познания. В завершение автор подводит итог развитию философской мысли, подготавливая почву для анализа немецкого идеализма.