На протяжении всего лета 1861 года в Чарлстоне и вдоль побережья Южной Каролины кипела работа по подготовке и обороне. 21 августа бригадный генерал Р. С. Рипли, чье повышение до этого звания было встречено аплодисментами со стороны солдат и граждан штата, был назначен в «департамент Южной Каролины и береговой обороны этого штата». Вступив в командование, генерал Рипли обнаружил, что губернатор и народ полностью осознают всю серьезность ситуации и делают всё возможное, что позволяют ограниченные ресурсы штата, для возведения укреплений и батарей на побережье, а также для вооружения и экипировки войск для службы штата и Конфедерации.
Губернатор Пиккенс написал военному министру в Ричмонд примерно во время федеральной экспедиции в Северную Каролину и захвата батарей у пролива Хаттерас, настоятельно прося прислать ему из Виргинии Первый полк Грегга, так как он ожидал нападения на какой-либо пункт побережья. В этом письме он умолял немедленно отправить из Норфолка 40 000 фунтов пушечного пороха. Губернатор приобрел в декабре 1860 года и январе 1861 года 300 000 фунтов пороха у мельниц Хэзарда в Коннектикуте для нужд штата, но он одолжил 25 000 фунтов губернатору Северной Каролины, 5000 фунтов губернатору Флориды и большое количество губернатору Теннесси. Из оставшегося ему требовалось 40 000 фунтов для обеспечения «около 100 орудий на побережье ниже Чарлстона». Губернатор оценил численность войск в фортах и на островах вокруг Чарлстона в 1800 человек, все они хорошо обучены, а резервные силы в городе — в 3000 человек. Эти силы вместе с полками Маниго, Хейварда, Дунованта и Орра он оценил примерно в 9500 боеспособных военнослужащих.
1 октября генерал Рипли доложил, что его силы Конфедерации, не считая батальона регулярной артиллерии и полка регулярной пехоты, насчитывают 7713 боеспособных военнослужащих, размещенных следующим образом: Первый стрелковый полк Орра на Салливанс-айленд — 1521; Первый полк Хэгуда на Коулс-айленд и каменных фортах — 1115; Двенадцатый полк Дунованта на Северном и Южном Эдисто — 367; Десятый полк Маниго в Джорджтауне и на укреплениях — 538; Четырнадцатый полк Джонса в лагере близ Эйкена — 739; Одиннадцатый полк Хейварда в Бьюфорте и на укреплениях — 758; кавалерия в лагере близ Колумбии — 173; кавалерия в лагере близ Эйкена — 62; арсенал в Чарлстоне (артиллерия) — 68; Тринадцатый полк Эдвардса, Пятнадцатый полк ДеСоссюра и остаток Двенадцатого полка Дунованта — 2372.
Первого ноября губернатор получил следующую депешу от исполняющего обязанности военного министра: «Я только что получил сведения, которые считаю абсолютно надежными, о том, что экспедиция противника направляется к Порт-Ройялу». Губернатор Пиккенс ответил: «Пожалуйста, дайте телеграмму генералу Андерсону в Уилмингтон и генералу Лоутону в Саванну с просьбой прислать те силы, какими они могут пожертвовать, так как наша трудность заключается в вооружении». Рипли ответил: «Действую немедленно. Дует прекрасный, сильный юго-восточный шторм, который удержит его в течение дня или около того». Флот вышел из Хэмптон-Роудс 29 октября, и 4 ноября головные корабли, выдержавшие шторм, появились у гавани Порт-Ройял. Буря разрушила несколько транспортов, и весь флот понес урон и задержался до 7 ноября, прежде чем адмирал Дюпон был готов начать атаку на форты, защищающие эту великую гавань.
Гавань Порт-Ройял защищали два форта: Уокер и Борегар: первый на острове Хилтон-Хед, а второй — на противоположном мысе Бэй-Пойнт. Расстояние через гавань от форта до форта составляет почти 3 мили, гавань просторна и глубока, а вода на баре позволяет крупнейшим судам заходить без риска. Флот из 100 парусников мог маневрировать между фортами Уокер и Борегар и оставаться вне досягаемости всех орудий, кроме самых тяжелых. Для защиты такого пункта требовались орудия наибольшей дальнобойности и самого тяжелого металлического веса.
Планируя оборону Порт-Ройяла, генерал Борегар рассчитывал, что на водных фасадах обоих фортов будут размещены батареи 10-дюймовых колумбиад и нарезных орудий, и отдал соответствующие распоряжения; однако орудий не было в наличии, и инженеры — майор Фрэнсис Д. Ли и капитан Дж. В. Грегори — были вынуждены установить на батареях фортов те орудия, которыми располагали правительство Конфедерации и губернатор Южной Каролины. Форты были превосходно спланированы и построены, а плантаторы в окрестностях фортов предоставили всю необходимую рабочую силу, так что к 1 сентября 1861 года они были готовы к установке орудий.
На форте Уокер было установлено двадцать орудий, а на форте Борегар девятнадцать, но из этого вооружения Уокер мог использовать лишь тринадцать, а Борегар — только семь против флота, атакующего с фронта. Остальные орудия были размещены для защиты от нападения с суши или были слишком легкими, чтобы принести какую-либо пользу. Двадцать орудий Уокера и Борегар, которые использовались в бою с флотом, были совершенно недостаточными как по весу металла, так и по количеству. Самыми тяжелыми орудиями в Уокере были две колумбиады (10-дюймовая и 8-дюймовая) и 9-дюймовое нарезное орудие Дальгрена. Остальные тринадцать были 42-, 32- и 24-фунтовыми. Из семи орудий в Борегаре одно было 10-дюймовой колумбиадой, а одно — 24-фунтовым нарезным орудием. Остальные были 42- и 32-фунтовыми; одно из последних стреляло раскаленными ядрами.
Полковник Уильям С. Хейвард из Одиннадцатого добровольческого полка Южной Каролины командовал фортом Уокер, а полковник Р. Г. М. Дуновант из Двенадцатого полка — фортом Борегар. Орудия в Уокере обслуживались ротами A и B Немецкой летающей артиллерии (капитаны Д. Вернер и Х. Хармс); ротой C Одиннадцатого добровольческого полка (капитан Джозайя Бедон) и отрядами из Одиннадцатого полка под командованием капитана Д. С. Канадея. Майор Артур М. Хьюджер из чарлстонского артиллерийского батальона командовал передними батареями и всем фортом после того, как полковник Джон А. Вагенер выбыл из строя. Орудия в форте Борегар обслуживались Бьюфортской артиллерией; ротой A Одиннадцатого добровольческого полка (капитан Стивен Эллиотт) и ротой D Одиннадцатого добровольческого полка (капитан Дж. Дж. Харрисон); капитан Эллиотт руководил стрельбой. Пехотная поддержка в Уокере состояла из трех рот Одиннадцатого и четырех рот Двенадцатого полков, а также роты конников под командованием капитана И. Х. Скривена. Таким образом, боевая сила форта Уокер утром 7 ноября, готовившаяся противостоять огромному флоту, собиравшемуся нанести удар, была представлена тринадцатью орудиями, которые обслуживали и поддерживали 622 человека. Пехотная поддержка в форте Борегар состояла из шести рот Двенадцатого полка, а общая численность сил в Борегаре под командованием полковника Дунованта составляла 640 человек при семи орудиях.
Бригадный генерал Томас Ф. Дрейтон со штаб-квартирой в Бьюфорте командовал обороной гавани Порт-Ройял и ее окрестностей. 5-го числа он перенес свой штаб на Хилтон-Хед и ускорил все возможные приготовления к предстоящему бою. Удаленное расположение форта Борегар и заслон из кораблей флота, стоявших чуть вне досягаемости, делали невозможным подкрепление этого пункта. Попытка, предпринятая рано утром 7-го числа при поддержке доблестного коммодора Тэттнала, была предотвращена реальным вмешательством головных боевых кораблей противника. Форт Уокер, однако, прямо перед началом боя получил подкрепление в виде Пятнадцатого добровольческого полка полковника ДеСоссюра численностью 650 человек; батареи капитана Рида из двух 12-фунтовых гаубиц (50 человек) и 450 джорджийских пехотинцев под командованием капитана Т. Дж. Берри.
Утро 7 ноября выдалось тихим, ясным и прекрасным, «ни единой ряби, — писал генерал Дрейтон, — на широком водном пространстве, которая могла бы нарушить точность стрельбы с широких палуб этой великолепной армады, готовившейся наступать в боевом порядке». Атака началась около 9 часов: девятнадцать боевых кораблей двинулись вперед, следуя друг за другом в сомкнутом строю, обстреливая форт Борегар по ходу движения, затем повернули налево и на юг, прошли в зоне досягаемости Уокера и обрушили бортовой залп за залпом на этот форт. Капитан Эллиотт докладывал: «Этот круг был совершен трижды, после чего они оставались вне досягаемости всех орудий, кроме наших самых тяжелых». С этой позиции тяжелый металл и дальнобойные орудия девятнадцати батарей вели непрекращающуюся бомбардировку как Борегара, так и Уокера, уделяя наибольшее внимание последнему.
Оба форта отвечали с решимостью, канониры преданно стояли у своих орудий, но значительно превосходящий вес металла и количество федеральных батарей, а также удаленность их позиций от фортов (не менее 2500 ярдов от Борегара и 2000 от Уокера) делали борьбу для конфедератов безнадежной почти с первого выстрела. Вскоре после начала боя несколько крупнейших судов заняли фланговые позиции вне досягаемости 32-фунтовых орудий в Уокере и продольным огнем обстреляли бруствер этого форта. «Как только эти позиции были заняты, — докладывал майор Хьюджер, — бой в форте велся просто ради чести, ибо с того момента мы были побеждены». Этот фланговый огонь вместе с непрекращающимися прямыми залпами тяжелых батарей флота вывел из строя или сбросил с лафетов большинство орудий форта Уокер. 10-дюймовая колумбиада вышла из строя в самом начале боя; снаряды для нарезных орудий оказались слишком большими для использования, а боеприпасы для всех орудий, кроме 32-фунтовых, истощились, когда после четырех часов тяжелого боя полковник Хейвард приказал обслуживать два орудия медленно, пока больных и раненых эвакуируют из форта; после этого форт предстояло оставить. Так завершился бой у форта Уокер.
В форте Борегар бой сложился для конфедератов более удачно. От огня флота взорвался зарядный ящик, разорвалось нарезное 24-фунтовое орудие, и в результате этих происшествий было ранено несколько солдат и офицеров, но ни одно из орудий не было сброшено с лафетов, и капитан Эллиотт прекратил стрельбу только тогда, когда Уокер был оставлен. В своем докладе он говорит: «Наш огонь был направлен почти исключительно на более крупные суда. Было видно, что они неоднократно получали попадания, но расстояние, составлявшее не менее 2500 ярдов, не позволяло нам определить степень полученных повреждений». Генерал Дрейтон успешно провел свое отступление с Хилтон-Хеда, а полковник Дуновант — с Бэй-Пойнта, и все войска благополучно сосредоточились на материке за Бьюфортом.
Взятие гавани Порт-Ройял 7 ноября 1861 года предоставило военно-морскому флоту Соединенных Штатов безопасную и просторную якорную стоянку, в то время как многочисленные и богатые острова вокруг нее обеспечивали абсолютно безопасные и комфортные места для лагерей армии генерала Т. В. Шермана, который непосредственно руководил этой экспедицией. Результатом этой победы Союза стало предоставление флоту и армии Соединенных Штатов постоянной и обильной оперативной базы против всего побережья Южной Каролины и против Чарлстона или Саванны по выбору федеральных властей; но худшим ее последлением стало немедленное оставление всей островной зоны вокруг Бьюфорта, причем дома и поместья плантаторов были преданы грабежу и разрушению, а тысячи рабов-негров попали в руки врага. Генерал Шерман писал своему правительству с Хилтон-Хеда, что эффект от его победы ошеломляем. Все белые жители покинули острова Хилтон-Хед, Сент-Хелена, Ледис и Порт-Ройял, а прекрасные поместья плантаторов оказались во власти орд негров.
Потеря фортов продемонстрировала мощь федерального флота и невозможность защитить островное побережье с помощью тех орудий, которые штат и Конфедерация могли предоставить. 32- и 42-фунтовые орудия не шли ни в какое сравнение с 11-дюймовыми батареями флота, а канонерские лодки с малой осадкой, несшие такие тяжелые орудия, могли проникать в многочисленные реки и ручьи и отрезать форты или батареи в уязвимых точках, в то время как более крупные суда атаковали их с фронта, как при Порт-Ройяле. Было очевидно, что богатые острова побережья находились во власти федерального флота, чьи многочисленные канонерские лодки и вооруженные пароходы, не встречая противодействия со стороны фортов или батарей, могли прикрывать высадку войск в любой точке или на любом выбранном острове.
После захвата Порт-Ройяла было, конечно, неясно, какими будут планы генерала Шермана и какими силами он располагает для наступления на железную дорогу между Чарлстоном и Саванной. Флота было вполне достаточно для любых наступательных целей вдоль побережья, но в то время не было известно, что численность армии составляет менее 15 000 человек в общей сложности. Зато хорошо было известно, как легко можно осуществить высадку в нескольких милях от железнодорожных мостов, пересекающих три верхних рукава Брод-Ривер — Кусоахатчи, Тулифинни и Покоталиго, а также более близкие к Чарлстону реки Комбахи, Ашепу и Эдисто. Блаффтон, до которого легко могли добраться канонерские лодки, предоставлял хорошую высадку и базу для операций против железной дороги у Хардивэлла, всего в 4 милях от реки Саванна и в 15 от города Саванна. По этой причине генерал Рипли при содействии плантаторов распорядился заградить верхние притоки Брод-Ривер и других рек в сторону Чарлстона, а тем временем разместил находившиеся под его командованием войска в пунктах, прикрывавших места высадки.
Генерал Дрейтон с частью кавалерийского полка Мартина под командованием подполковника Колкока, а также с полками Хейварда и ДеСоссюра наблюдал за Блаффтоном и дорогами на Хендерсонвилл. Северокаролинские полки Клингмена и Рэдклиффа с артиллерией под командованием полковника А. Дж. Гонсалеса, кавалерийская рота капитана Трезеванта, а также чарлстонские легкие драгуны и стрелки Ратледжа были размещены перед Грэхемвиллом для наблюдения за местами высадки с Брод-Ривер. Полк полковника Эдвардса и легкая батарея Мура находились в Кусоахатчи, полк полковника Дунованта — в Покоталиго, а полк полковника Джонса с кавалерийской ротой Триппа — перед важным пунктом высадки у Порт-Ройял-ферри. Полковник Мартин с частью своего кавалерийского полка вел наблюдение за местами высадки на реках Комбахи, Ашепу и Эдисто. Смысл этого размещения, осуществленного Рипли сразу после падения фортов Уокер и Борегар, заключался в охране железнодорожных мостов и удержании войск под рукой для переброски с целью сосредоточения в случае нападения на какой-либо определенный пункт.
8 ноября, на следующий день после взятия Порт-Ройяла, генерал Роберт Э. Ли принял командование департаментом Южной Каролины и Джорджии по приказу президента Конфедерации. Ему было очевидно, что устья рек и морские острова, за исключением тех, что непосредственно окружают гавань Чарлстона, не могут быть защищены с помощью имеющихся в его распоряжении орудий и войск, и, как ни разочаровывало и не огорчало это мнение губернатора и особенно островных плантаторов, чьи дома и поместья должны были быть оставлены и разорены, генерал Ли готовился к неизбежному. Он написал генералу Рипли в Чарлстон с предложением пересмотреть весь вопрос и высказать соображения о том, какие изменения следует внести. «Я выступаю за то, — писал он, — чтобы по возможности оставить все уязвимые точки в пределах досягаемости флота канонерских лодок противника и занять внутренние позиции, где все смогут встретиться на более равных условиях. Все наши ресурсы должны быть направлены на эти позиции». Впоследствии правительство в Ричмонде отдало генералу Ли приказ по телеграфу отвести все свои силы с островов на материк. Когда этот приказ выполнялся, это было сопряжено с ужасной жертвой, на которую плантаторы и граждане пошли с терпеливым и благородным смирением, повернувшись спиной к своим домам и своему имуществу с самоотверженной преданностью делу южной независимости. Никогда еще мужчины и женщины не подвергались столь суровому испытанию глубины и силы своих чувств или столь тяжелой проверке на патриотизм, как плантаторы и их семьи, которые оставили свои дома и поместья вдоль побережья Южной Каролины и удалились в качестве беженцев вглубь страны, причем все способные мужчины вступили в армию.
Ко времени падения фортов Уокер и Борегар гавань Чарлстона защищали форты Молтри и Самтер, замок Пинкни и форт Джонсон, а также батареи на островах Салливанс и Моррис. Все они подлежали усилению, а гавань — обеспечению безопасности от любых атак с фронта. Чтобы предотвратить оккупацию острова Джеймс, устье реки Стоно защищали форты, построенные на островах Коулс и Бэттери, а также линия оборонительных сооружений, возведенная поперек острова. Не предпринималось никаких попыток возвести форты или батареи для защиты проливов Уорт или Южный Эдисто, но гавань Джорджтауна защищали незавершенные сооружения на островах Кэт и Саут, рассчитанные на двадцать орудий, самыми тяжелыми из которых были 32-фунтовые.
Когда генерал Ли принял командование 8 ноября, он установил свою штаб-квартиру в Кусоахатчи и разделил линию обороны на пять военных округов с востока на запад следующим образом: Первый — от границы Северной Каролины до Южного Санти, под командованием полковника А. М. Маниго из Десятого добровольческого полка, со штаб-квартирой в Джорджтауне; Второй — от Южного Санти до Стоно, под командованием генерала Р. С. Рипли, со штаб-квартирой в Чарлстоне; Третий — от Стоно до Ашепу, под командованием генерала Н. Г. Эванса, со штаб-квартирой в Адамс-Ране; Четвертый — от Ашепу до входа в Порт-Ройял, под командованием генерала Дж. К. Пембертона, со штаб-квартирой в Кусоахатчи; Пятый — оставшаяся часть линии до реки Саванна, под командованием генерала Т. Ф. Дрейтона, со штаб-квартирой в Хардивэлле.
27 декабря генерал Ли написал губернатору Пиккенсу, что его мобильные силы для обороны штата, не считая гарнизонов фортов в Джорджтауне и гарнизонов Молтри, Самтер, Джонсон, замка Пинкни и сооружений для обороны подступов через Стоно, Ваппу и т. д., которые не могли быть сняты со своих постов, составляли 10 036 военнослужащих Конфедерации: Четвертая бригада ополчения Южной Каролины численностью 1531 человек; конный полк полковника Мартина численностью 567 человек; два полка из Северной Каролины — Клингмена и Рэдклиффа; два полка из Теннесси — Восьмой и Шестнадцатый, а также виргинский полк полковника Старка; причем теннессийцы и виргинцы составляли бригаду под командованием бригадного генерала Дональсона. Упомянутые силы вместе с четырьмя полевыми батареями составляли войска, рассредоточенные от Чарлстона до реки Саванна и размещенные вдоль линии на материке перед вышеупомянутыми штаб-квартирами.