Второе послание Иоанна представляет собой короткое пастырское письмо, адресованное «избранной госпоже» и её детям. Автор, называющий себя «старцем», выражает радость по поводу того, что дети адресата следуют истине и заповедям Божьим. Основная тема послания — призыв к взаимной любви и строгому соблюдению учения Христа. Иоанн предостерегает верующих от «обольстителей» и «антихристов», которые отрицают пришествие Иисуса Христа во плоти.
Он наставляет не принимать таких людей в дом и не оказывать им поддержки, чтобы не стать соучастниками их злых дел. Послание завершается выражением надежды на личную встречу, которая должна принести полноту радости, и приветствием от детей избранной сестры. Текст подчеркивает важность доктринальной чистоты и бдительности в христианской общине, напоминая, что пребывание в учении Христа является единственным способом иметь общение с Отцом и Сыном.