Хотя Несторий был осужден, перед Церковью встала проблема. Возражение было верным: если Логос и разумная душа во Христе сливались воедино так, что разумная душа, или дух, теряла себя в своем источнике, то Логос пребывал в животном теле, и полная человечность Христа исчезала. Несторианский взгляд на временную «связь» был теперь осужден как еретический, но было ли необходимо впадать в другую крайность — «слияние», которое было логическим результатом александрийского учения? Церковь хотела быть философски корректной и в то же время избежать выводов, которые могли быть сделаны из любого взгляда в его крайней форме. На самом деле, безжалостно проводимая философия была той опасностью, которой Церковь боялась больше всего, чувствуя в какой-то смутной области подсознания, что залог веры не совсем согласуется с наукой, или, по крайней мере, с наукой, модной в то время; и настоящими врагами Церкви были энтузиасты, уверенные в том, что доктрина и философия абсолютно истинны. И мы даже в наши дни не до конца усвоили урок, что и то, и другое все еще являются частичными и прогрессивными. Исламу пришлось пройти через точно такой же опыт в свое время, и он вышел из него с очень похожими результатами, то есть и христианская, и мусульманская церкви в конечном итоге выбрали «via media», приняв философское изложение доктрины, но осудив как еретические логические выводы, которые могли быть сделаны. Александрийская школа, возможно, воодушевленная своей победой над Несторием, стала довольно невоздержанной в изложении своих взглядов и довела их до крайнего вывода. Предупреждающее предсказание несториан немедленно оправдалось: учение о «слиянии» Логоса и разумной души во Христе полностью подрывало его человечность. Последовал еще один спор, и в нем, как и в предыдущем, ни одна из сторон не выражала сомнений в психологии или метафизике, заимствованных из аристотелевской и неоплатонической философий; это повсюду принималось как нечто само собой разумеющееся, проблема заключалась в том, чтобы привести христианское учение в соответствие с ними. Теперь те, кто выступал против александрийских выводов, отстаивали теорию «союза» между Логосом и разумной душой во Христе, так что сохранялась полная человечность, а также божественность, и союз был таким, что становился неразрывным и, следовательно, защищенным от несторианской теории. Фактически это было просто признанием философского утверждения и запретом на доведение его до возможных выводов. Это описывается как «ортодоксальная» доктрина, и справедливо в том смысле, что она выражает, хотя и в философских терминах, доктрину в том виде, в каком она существовала до того, как Церковь изучила какую-либо философию, и исключает возможные дедукции, которые попадали в поле зрения, как только делалось философское утверждение. Это нормальный результат, когда доктрина, первоначально выраженная теми, кто не знал философии, должна быть облечена в логические и научные термины: единственным ортодоксальным представлением традиционной веры должен быть компромисс.
Этот второй спор привел к Халкидонскому собору в 448 году н. э., на котором сторонники теории «слияния» были изгнаны из государственной церкви, и таким образом сформировалось третье тело, каждое из которых претендовало на представление истинной веры. Практически вся Египетская церковь последовала за «слиятелями», или монофизитами, или яковитами, как их называли по имени Иакова Саругского, который сыграл главную роль в организации их как церкви: в Сирии они также имели сильную поддержку. Подобно несторианам, они подвергались преследованиям со стороны императора и государственной церкви, но, в отличие от них, они не мигрировали за пределы Византийской империи, а оставались важным, хотя и сильно недовольным телом в ее пределах, хотя позже они посылали ответвления в другие земли. Подобно несторианам, они стремились отказаться от языка своих гонителей и использовать народные коптский и сирийский языки: справедливо утверждается, что золотой век сирийской литературы и философии начинается с монофизитского раскола. Однако любопытная линия разграничения наблюдается в сирийском языке между яковитами на Западе и несторианами на Востоке: они использовали разные диалекты, что, вероятно, является результатом их географического распределения, и они использовали разные шрифты при письме, что отчасти было связано с преднамеренным намерением, хотя отчасти также с использованием слегка отличающихся инструментов для письма.
Когда мы рассматриваем результаты монофизитского и несторианского расколов, мы начинаем понимать, почему так много греческого философского материала было переведено на сирийский язык, в то время как несторианское движение было эффективной причиной того, почему сирийский язык постепенно стал средством передачи эллинистической культуры в те части Азии, которые лежали за пределами Византийской империи в течение столетий, непосредственно предшествовавших распространению ислама. Очевидно, что поздние аристотелевские и неоплатонические философы имели жизненно важное значение для всех, кто участвовал в теологических спорах того времени, а аристотелевская логика имела равное значение, поскольку от нее зависело то, как использовались термины. После отделения от Греческой церкви несториане и монофизиты обратились к христианам, говорившим на народном языке, и поэтому большое количество философского, а также теологического материала было переведено на сирийский язык; гораздо меньше — на коптский, ибо египетским монофизитам не приходилось сталкиваться с таким количеством споров, как их собратьям в Сирии.
Период между расколами и началом мусульманского интереса к философии был периодом плодовитого перевода, комментирования и изложения. Хотя существует большой интерес к прослеживанию литературной истории нации, сравнительно мало интереса к истории литературы, которая ограничивается деятельностью такого рода, ибо это не может быть чем-то большим, чем список имен. Комментарий и эссе могли бы действительно открыть область оригинальности, но ничего подобного не появляется в этом типе сирийской работы: кажется, что провинциализм, последовавший за отделением от греческого мира, принес сужающие ограничения, так что, хотя мы получаем способных и прилежных работников, они никогда не кажутся способными продвинуться дальше пересказа, более или менее точного, уже достигнутых результатов.
Помимо философии и богословия, мы находим значительный интерес к медицине и двум наукам — химии и астрономии, которые рассматривались как родственные ей, ибо астрономия, рассматриваемая с астрологической точки зрения, считалась тесно связанной с условиями жизни и смерти, здоровья и болезни. Медицинские исследования были особенно привязаны к школе Александрии. Философия в собственном смысле была настолько сильно поглощена богословием, что светские исследователи были скорее побуждены обратиться к естественным наукам, и как центр медицинских и смежных исследований древняя школа Александрии продолжала свое развитие без потери преемственности, но в изменившихся условиях. Иоанн Филопон, или Иоанн Грамматик, как его называли, был одним из поздних комментаторов Аристотеля, а также одним из ранних светил этой медицинской школы. Дата его смерти неизвестна, но он преподавал в Александрии в то время, когда Юстиниан закрыл школы в Афинах в 529 году н. э. Следующим великим лидером этой школы был Павел Эгинский, который процветал во время мусульманского завоевания и чьи труды долгое время служили популярными руководствами по медицине. Основатели медицинской школы в Александрии установили регулярный курс обучения для подготовки практикующих врачей, и для этой цели выбрали шестнадцать трудов Галена, некоторые из которых были переизданы в сокращенном виде и стали предметом регулярных пояснительных лекций. В то же время школа стала центром оригинальных исследований не только в медицине, но и в химии и других отраслях естествознания. Таким образом, накануне мусульманского завоевания Александрия стала великим домом научных исследований. В некоторой степени это было прискорбно, так как существующие традиции в Египте направляли эти исследования в значительной степени в обскурантистское русло и склоняли к использованию магических форм, талисманов и т. д., а также к привнесению астрологического уклона. Это впоследствии стало большим недостатком арабской медицины, как видно позже даже в средневековой Падуе, но это была не вина ислама, это было наследие Александрии. Тот материал, который остался от сирийских исследований, показывает нам более здравый и надежный метод, бытовавший там, но Александрия затмила сирийских ученых во время мусульманского нашествия, по крайней мере в общественном мнении, и это стало определяющим фактором в направлении арабских исследований по этим астрологическим побочным путям.
Среди знаменитых продуктов этой школы был Павел Эгинский, чьи медицинские труды легли в основу большей части средневекового арабского и латинского преподавания, и священник Арун (Аарон), который составил руководство по медицине, впоследствии переведенное на сирийский язык и ставшее популярным авторитетом. Александрия была также центром химической науки и как таковая была прародительницей поздней арабской алхимии. Из исчерпывающего исследования арабской химии М. Бертло (La chimie au moyen age: Париж, 1893) следует, что арабский материал можно разделить на два класса: один основан на греческих писателях, популярных в Александрии, и в основном переведен с них, другой представляет более позднюю школу независимых исследований. Из первого класса Бертло приводит три образца: Книги Кратеса, аль-Хабида и Остана, все они представляют греческую традицию, процветавшую в Александрии накануне мусульманского нашествия.
В то время как александрийцы поддерживали интерес к медицине и смежным наукам, разделенные ветви церквей Азии, говоривших на народных языках, больше интересовались логикой и умозрительной философией. Было, пожалуй, естественно, что монофизиты с их сильной египетской связью приняли комментарии Иоанна Филопона, который сам был монофизитом определенного типа, но и они, и несториане неизменно использовали «Исагогу» Порфирия в качестве вводного руководства. В общем подходе к метафизике и психологии, применяемых к богословию, и в подходе к самому богословию монофизиты больше склонялись к неоплатонизму и мистицизму, чем несториане, и их жизнь больше сосредоточивалась в монастырях, в то время как несториане придерживались скорее старой системы местных школ, хотя у них тоже были монастыри, и со временем школы приняли дисциплину и методы монастыря.
Старейшей и величайшей из несторианских школ была школа в Нисибисе, но в 550 году н. э. Мар Аба, обращенный из зороастризма, ставший католикосом или патриархом несториан, основал школу в Селевкии по образцу Нисибиса. Чуть позже персидский царь Хосров Ануширван (Нуширван, расцвет 531-578 гг. н. э.), который был глубоко впечатлен взглядом на эллинистическую культуру, полученным во время войны с Сирией, и предложил гостеприимство изгнанным греческим философам, когда Юстиниан закрыл школы в Афинах, основал зороастрийскую школу в Джунди-Шапуре, в Хузистане, где не только греческие и сирийские труды, но и философские и научные сочинения, привезенные из Индии, переводились на пехлеви, или среднеперсидский язык, и там изучение медицины, преподаваемой греческими и индийскими врачами, развивалось более полно, чем в теологической атмосфере христианских школ, хотя некоторые из самых выдающихся медицинских учителей в этой школе сами были несторианскими христианами. Среди выпускников Джунди-Шапура были араб Харис ибн Калада, который впоследствии стал знаменит как практикующий врач, и его сын Эннадр, цитируемый в 5-м каноне Ибн Сины (Авиценны), враг пророка Мухаммада, который был среди побежденных в битве при Бадре и был казнен Али. Несколько индийских медицинских писателей цитируются Разесом и другими, в частности Шарак и Колхоман, в то время как трактат о ядах индийца Шанака был позже переведен на персидский язык Манкой для Яхьи ибн Халида Бармакида, а затем на арабский для аббасидского халифа аль-Мамуна. Манка, который был лечащим врачом Харуна ар-Рашида, перевел с санскрита различные медицинские и другие труды. Помимо христианских и зороастрийских школ, существовала также языческая школа в Харране, о чьем основании у нас нет дальнейшей информации. Харран был центром эллинского влияния со времен Александра Македонского и оставался убежищем для старой греческой религии, когда греческий мир в целом стал христианским. Хотя, по-видимому, Харран имел наследие от древней вавилонской религии, которая пережила поздний расцвет в первые века христианской эры, оно было полностью покрыто наслоениями язычества, пересмотренного неоплатониками. Действительно, Харран демонстрирует последний оплот греческого язычества и неоплатонизма в том виде, в каком они были сформулированы Порфирием, и они продолжали там вести энергичную, хотя и уединенную жизнь.
Таким образом, существовало несколько агентств, развивавших и расширявших эллинистическое влияние в Персии и Месопотамии, которая позже стала персидской провинцией, и помимо этих основанных школ было много вторичных сил. Персидские армии, возвращавшиеся после вторжения в Сирию, привезли много элементов эллинской культуры, среди них греческую систему бань, которая была скопирована в Персии и продолжена мусульманами, распространившими это утончение по всему исламскому миру, так что то, что мы называем турецкой баней, является прямым потомком старой греческой бани, прошедшей через персов доисламских времен, а затем более широко распространенной мусульманами. Эти армии привезли домой также огромное восхищение греческой архитектурой и инженерией, и греческие архитекторы, инженеры и ремесленники, будучи одними из самых ценных трофеев, привезенных из Сирии, с их помощью Персия попыталась начать строительство в греческом стиле. Таким образом, столетия, непосредственно предшествовавшие распространению ислама, показывают широкое и устойчивое расширение эллинистических влияний во всех различных формах культуры: в науке, философии, искусстве, архитектуре и в предметах роскоши; и даже до этого, со времен Александра Македонского, происходило просачивание греческого влияния, так что Западная Азия была пропитана эллинистическим искусством, во многих случаях очень грубо представленным и объединенным с местными элементами. Когда гнетущий контроль Омейядов был снят и местное население снова пришло к своему, мы вряд ли можем удивляться, что это означало возрождение эллинизма.
Мы уже упоминали Ибу (ум. 457) как учителя Барсумы, который возглавил несторианскую миграцию в Персию и вновь открыл школу в Нисибисе. Этот Иба был великим светилом школы Эдессы в ее последние дни и, по-видимому, первым сделал сирийский перевод «Исагоги» Порфирия, признанного руководства по логике, подготовительного к «Органону» Аристотеля. Это показывает, что логика была принята в качестве основного материала образования среди несториан, и очень похожее положение, по-видимому, было среди монофизитов.
Примерно в то же время процветал Проб, который, как говорят, был пресвитером Антиохии и создал комментарии к «Исагоге» Порфирия, а также к «Об истолковании», «О софистических опровержениях» и «Первой аналитике» Аристотеля; эти комментарии стали любимыми руководствами среди сирийскоязычных студентов логики. «De Hermeneuticis apud Syros» Хоффмана (Лейпциг, 1873) дает текст комментария к «Об истолковании», за которым следует латинский перевод. Метод, используемый здесь и во всех сирийских комментариях, заключается в том, чтобы взять короткий отрывок, часто не более нескольких слов, текста Аристотеля, переведенного на сирийский язык, а затем дать объяснение смысла, иногда растягивающееся на несколько страниц, иногда лишь краткое замечание, в зависимости от сложности текста, очень похоже на то, как если бы учитель читал вслух и объяснял отрывок за отрывком по мере чтения. Это стало обычным методом комментирования и впоследствии было скопировано мусульманами в их комментариях к Корану. Комментарий к «Исагоге» был опубликован Баумштарком («Aristotles bei den Syrern», Лейпциг, 1900), а комментарий к «Первой аналитике» — великим лувенским ученым профессором Хунакером в «Journal Asiatique» за июль-август 1900 года.
Величайшим из монофизитских ученых был Сергий из Рас-эль-Айна (ум. 536), который был одновременно переводчиком и автором оригинальных трактатов по философии, медицине и астрономии. Его медицинская работа была его главным интересом, и он оставил неизгладимый след как переводчик на сирийский язык значительной части трудов Галена. Он провел некоторое время в Александрии, где усовершенствовал свои знания греческого языка и изучил химию и медицину в александрийской медицинской школе, тогда только начинавшей свою карьеру. Часть его перевода Галена сохранилась в рукописях Британского музея Addit. 14661 и 17156: в последней есть фрагменты «Искусства медицины» и «О свойствах пищевых продуктов», которые были отредактированы Сахау (Inedita Syriaca, Вена, 1870). Из его философских работ Сахау дал нам версии, которые он сделал для «Исагоги» и «Таблицы» Порфирия, «Категорий» Аристотеля и сомнительного «О мире», а также трактат «О душе», который не является «О душе» Аристотеля. Он написал оригинальные трактаты по логике в семи книгах (неполные — Brit. Mus. Add. 14660 содержит трактат о категориях), о «отрицании и утверждении», о «роде, виде и индивиде», о «причинах вселенной согласно Аристотелю» и второстепенные эссе. В астрономии он оставил трактат «О влиянии луны», который основан на труде Галена (ср. Sachau, op. cit.). Труды Сергия циркулировали как среди несториан, так и среди монофизитов, все они считали его ведущим авторитетом в медицине и логике, и в медицине, по-видимому, он был основателем сирийской школы, которая стала прародительницей арабской медицины; безусловно, эта школа была обязана своим импульсом ему. Бар-Эбрей называет его «человеком красноречивым и весьма искусным в книгах греков и сирийцев и ученейшим врачом человеческих тел. Он был действительно ортодоксален в своих мнениях, как свидетельствует «Пролог», но в морали развращен, порочен и запятнан похотью и алчностью» (Bar Hebraeus. ed. Abbeloos et Lamy. i. 205-7).