В своей работе «Идея Бога в свете современного знания» Джон Фиске ставит целью примирить религиозное мировоззрение с достижениями науки XIX века, в частности с теорией эволюции. Автор утверждает, что традиционные представления о Боге, основанные на антропоморфных образах и идее «внешнего» творца, устарели и вступают в конфликт с научным пониманием мира. Фиске критикует как узколобый теологический догматизм, так и материалистический атеизм, предлагая вместо них концепцию «космического теизма». Согласно этой концепции, Бог не является внешним механиком, управляющим миром через чудеса, а представляет собой имманентную, вездесущую Энергию, проявляющуюся через естественные законы и эволюционный процесс.
Фиске подчеркивает, что эволюция — это не слепой и бессмысленный процесс, а драматическое движение к высшей цели, которой является развитие человеческого духа и нравственности. Он опирается на идеи Афанасия Александрийского, Спинозы и Гёте, утверждая, что Бог познаваем лишь символически, как источник нравственного закона и разумности мироздания. Автор настаивает на том, что наука, изучая «как» происходят явления, не может опровергнуть теистическую веру в «почему», так как сама природа эволюции указывает на наличие телеологического начала.
Книга является логическим продолжением работы «Судьба человека» и призывает читателя увидеть в научном прогрессе не угрозу религии, а инструмент для её очищения от суеверий и примитивных представлений. Фиске доказывает, что вера в разумность Вселенной и в то, что человечество является её венцом, не только совместима с наукой, но и находит в ней свое высшее подтверждение. В конечном счете, автор приходит к выводу, что Бог — это бесконечная и вечная Сила, действующая во благо, и что признание этого факта является необходимым условием для полноценного интеллектуального и духовного развития человека. Работа Фиске остается важным памятником философской мысли, отражающим попытку интеллектуалов того времени найти синтез между верой и рациональным познанием мира, утверждая, что ни одна часть Вселенной не является «безбожной», а каждое научное открытие лишь глубже раскрывает величие творческого начала.