В своей работе «Механико-физиологическая теория органической эволюции» Карл фон Негели предлагает альтернативный дарвинизму взгляд на механизмы эволюционного процесса. Автор постулирует существование «идиоплазмы» — особого вещества, передающегося из поколения в поколение и являющегося носителем наследственных детерминант. Согласно Негели, эволюция направляется двумя основными силами: внутренним «автономным процессом совершенствования» (стремлением к усложнению организации) и внешней адаптацией к условиям среды. Негели развивает свою знаменитую мицеллярную теорию, согласно которой живые организмы состоят из мельчайших кристаллических структур — мицелл, окруженных водными пленками.
Рост и развитие организма рассматриваются как результат интуссусцепции (внедрения) новых мицелл в структуру идиоплазмы. Автор подробно анализирует процессы филогенеза, утверждая, что виды возникают не через случайный отбор, а через закономерное усложнение идиоплазматической конфигурации. В книге также рассматриваются вопросы спонтанного зарождения жизни, природа наследственности, изменчивости и классификация организмов. Негели критикует дарвиновский естественный отбор, отводя ему лишь второстепенную роль «прореживания» уже существующих ветвей эволюционного древа. Работа представляет собой важный исторический этап в развитии биологической мысли, предвосхищая многие идеи о преемственности наследственного материала, хотя и опираясь на физико-химические аналогии своего времени.